OpenNeuro
OpenNeuro est une plateforme collaborative regroupant des jeux de données en neurosciences issus d’expérimentations humaines. On y trouve des enregistrements d’IRM (IRM anatomique et fonctionnelle), d’EEG et de MEG, provenant d’études scientifiques variées. L’ensemble est structuré selon les standards BIDS pour favoriser la reproductibilité des analyses.
Plusieurs téraoctets de données, formats NIfTI (neuroimagerie) et BIDS (Brain Imaging Data Structure)
Accès libre sous licence Creative Commons (CC0), entièrement ouverte à la réutilisation scientifique
Description
Le corpus OpenNeuro couvre un large éventail de données cérébrales :
- IRM structurelle, IRM fonctionnelle (fMRI), DTI (diffusion), etc.
- EEG (électroencéphalogramme) en contexte de repos ou de tâche cognitive
- MEG (magnétoencéphalogramme) pour la dynamique cérébrale
- Données comportementales associées (temps de réaction, scores, questionnaires…)
- Métadonnées harmonisées (âge, sexe, groupes de sujets, pathologies éventuelles)
Les datasets sont souvent liés à des publications scientifiques et accessibles via navigateur, CLI ou API.
À quoi sert ce dataset ?
OpenNeuro est utilisé pour :
- L’étude des connectivités cérébrales et des circuits neuronaux
- L’entraînement de modèles de deep learning en neuro-imagerie
- La détection de marqueurs neurologiques liés à des pathologies (Alzheimer, autisme, schizophrénie…)
- Le développement d’outils d’analyse de données BIDS-compliant
- La recherche en neurosciences cognitives, psychiatrie, et neurotechnologies
Peut-on l’enrichir ou l’améliorer ?
Oui, grâce à :
- L’alignement multi-modal entre IRM, EEG et comportements
- L’ajout de labels cliniques ou comportementaux par annotation secondaire
- L’exploitation de pipelines automatisés avec des outils comme fMRIPrep, MNE, Brainstorm, etc.
- La combinaison avec des bases de données comme HCP, UK Biobank ou NeuroVault
🔗 Source : OpenNeuro Dataset
Questions fréquemment posées
Peut-on utiliser OpenNeuro pour l’analyse d’IRM fonctionnelle (fMRI) ?
Oui, une grande partie des datasets contient des sessions fMRI structurées selon le standard BIDS, prêtes à être utilisées avec les outils d’analyse les plus courants.
Les données sont-elles anonymisées ?
Oui. Toutes les images IRM sont dé-identifiées, avec les visages floutés et les métadonnées sensibles supprimées, conformément aux bonnes pratiques.
Est-il possible de contribuer à OpenNeuro ?
Oui, les chercheurs peuvent déposer leurs propres jeux de données via un processus encadré. Cela favorise l’open science et la réplicabilité.
